ラングミュア. 2014年7月1日;30(25):7465-74. doi: 10.1021/la500403v. Epub 2014年6月17日.
ポリエチレングリコール、アルキル、オリゴヌクレオチドスペーサーがフラクタルカイン結合FKN-S2アプタマー両親媒性物質の結合、二次構造、自己組織化に及ぼす影響
抽象的な
我々は以前、細胞表面タンパク質フラクタルカインに高い親和性と特異性で結合するFKN-S2というアプタマーを同定した。本論文では、疎水性ジアルキルC16テールをアプタマーに付加し、アプタマー両親媒性物質を作製した。テールと、テールとアプタマーヘッドグループの間に挿入された、長さと疎水性が異なるスペーサー分子が、アプタマー両親媒性物質の結合、構造、自己組織化特性にどのような影響を与えるかを調査した。スペーサーなし（NoSPR）、ポリエチレングリコール（PEG4、PEG8、PEG24）、アルキル（C12およびC24）、またはオリゴヌクレオチド（T10およびT5：チミン10個および5個、A10：アデニン10個）のスペーサーを有するアプタマー両親媒性物質を合成した。テールの追加により、アプタマー-両親媒性物質の結合親和性は、遊離アプタマーと比較して7.5倍以上低下しました。疎水性アルキルスペーサーは親和性の低下が最も大きく、親水性PEGスペーサーは両親媒性物質の親和性を向上させましたが、遊離アプタマーの親和性まで回復しませんでした。興味深いことに、オリゴヌクレオチドスペーサーは最も高い親和性を持つ両親媒性物質を生成しました。しかし、T10スペーサーとA10スペーサーの親和性は同等であったため、ヌクレオチド組成は親和性に影響を与えませんでした。オリゴヌクレオチドスペーサー両親媒性物質は、オリゴヌクレオチドスペーサーが遊離アプタマーの親和性を高めるため、最も高い親和性を示しました。FKN-S2アプタマーとオリゴヌクレオチドスペーサーの組み合わせは、遊離FKN-S2アプタマーよりも高い親和性を示しました。円二色性（CD）分光法および熱融解試験から、アプタマーはステムループと分子内グアニン四重鎖を形成し、その末端が緩衝液中でグアニン四重鎖の形成を強力に安定化することが示唆された。極低温透過型電子顕微鏡（cryo-TEM）画像では、アプタマー両親媒性物質は、使用したスペーサーの種類に依存せず、ミセルおよびナノテープ（しばしばねじれた平面二重層構造）へと自己組織化することが示された。最後に、FKN-S2両親媒性物質で修飾したリポソームをフラクタルカイン発現細胞と共にインキュベートしたところ、結合量はリポソーム表面の両親媒性物質濃度に依存していた。
